L1-S2

30BU01SV - Développement animal et végétal

Responsables pédagogiques : Christine Lelandais (BV), Véronique Borday-Birraux (BV), Christine Rampon (BA)

Résumé du programme :

Développement chez les animaux

Cours magistral :
Le développement embryonnaire chez les animaux
Gamétogenèse et fécondation
Généralités sur le développement embryonnaire chez les animaux
Deux exemples de construction du plan d’organisation d’un organisme : développement embryonnaire d’un vertébré et d’un insecte (description et méthodologie) TD : la neurulation chez les amphibiens : un exemple d’organogenèse TP1 : la gastrulation chez les amphibiens TP2 : histologie animale TP3 : le développement embryonnaire chez la drosophile

Développement chez les Angiospermes
Rappels sur l’architecture d’une plante à fleur
Généralités sur le développement embryonnaire
Développement post-embryonnaire : l’exemple de la tige feuillée
Hormones végétales et développement 3 séances de cours-TD : Construction de l’appareil racinaire
TD1 : Le méristème apical racinaire : centre d’organisation de la racine
TD2 : Les racines latérales et les poils absorbants : deux exemples d’organogenèse et de différenciation cellulaire
TD3 : L’auxine : une hormone essentielle TP1 : Les hormones végétales : quelques exemples TP2 : Les méristèmes de la tige TP3 : Les graines : diversité et développement

30BU02SV - Biologie moléculaire et génétique 1

Responsable pédagogique : Véronique Joliot

Résumé du programme :

Structure biochimiques des nucléotides, de l’ADN et de l’ARN,
Propriétés et synthèse (réplication) de l’ADN.
L’ADN support de l’information génétique
Le polymorphisme de l’ADN : De la mutation au phénotype.
Le maintien et le brassage de l’information génétique
L’analyse génétique. Transmission des caractères à la méiose
Propriétés et synthèse (transcription) de l’ARN chez les procaryotes et chez les eucaryotes,
Maturation des ARN eucaryote et importance biologique de l’épissage.
Maturation des ARN eucaryote et importance biologique de l’épissage.
La traduction procaryote et eucaryote,
Les outils du génie génétique, applications en biologie et en santé.

30BU03SV – Outils pour Biologistes 2

Responsables pédagogiques : Laurent Ménard, Mathilde Badoual, Samuel Bottani

La quantification occupe aujourd’hui une place croissante en Biologie. Dans ce contexte, l’objectif général du cours est de montrer comment la physique, à travers ses méthodes mais également ses concepts, peut aider à accéder à cette quantification et à mieux appréhender la complexité d’un système biologique.

Il s’agit de montrer comment des principes de physique simples peuvent permettre de mieux comprendre le fonctionnement et les limites d’un système biologique. Le cours sera structuré autour d’un thème conducteur riche et accessible, qui ouvre à une grande variété d’exemples : le métabolisme et la transmission d’informations (son, lumière) chez les animaux.

Résumé du programme :

1 - Objectifs du cours et introduction à l’interface Maths-Physique-Chimie-Biologie : construire des modèles avec la physique et les mathématiques pour comprendre la biologie ; exemples.
2 et 3 - Les origines du mouvement : notion de force, vitesses, accélération, PFD. Types de forces et d’interactions en Biologie
4 - L’énergie du vivant : différentes formes d’énergie et conservation. Illustration de la conservation de l’énergie à l’échelle cellulaire.
5 - Allométrie et lois d’échelle (métabolisme, effet de la taille)
6 - Cycles et rythmes en biologie : mouvements périodiques, oscillateur harmonique, fréquence de vibration propre, harmoniques, résonance
7 - Introduction aux ondes : ondes mécaniques/EM, propagation, énergie transportée. Ondes et biologie.
8 - Le son : interaction avec la matière (réflexion/réfraction/diffraction), effet Doppler.
9 - Mécanisme de l’audition : formation (membrane oscillante, stridulation, cordes vocales) et détection du son (oreille).
Illustration sur les perceptions animales.
10 - La lumière : production (rayonnement thermique, fluorescence, bioluminescence, laser) et interaction avec la matière (ionisation, échauffement)
11 et 12 - Mécanisme de la vision : évolution des yeux. Ouverture à la microscopie.
13 - Les couleurs dans la nature : origine physique, production et perception

30BU04SV - De l’atome à la Chimie organique

Responsables pédagogiques : Rémi Losno, Chan Zhi Dong, Thanh Ha Duong

Résumé du programme :

Chapitre 1 : l’atome (5h C et 5h TD)
noyau et électrons : composition du noyau, isotopes et élément, A et Z, forme de l’atome, disposition des électrons en couches et sous-couches, configuration électronique, état fondamental, électrons de coeur et électrons de valence.
masse atomique, rayon atomique, composition isotopique naturelle des éléments, masse molaire élémentaire.
interaction photon/atome, spectre de l’atome d’hydrogène, niveaux d’énergies, force d’attraction électrique, écrantage des électrons de coeur.
forme des nuages électroniques s, p, d
Rayon atomique, énergie d’ionisation, affinité électronique, évolution dans le tableau périodique.

Chapitre 2 : construire une molécule (6h C et 6h TD)
Le modèle de Lewis, règle de l’octet, squelette sigma, liaisons pi et doublets libres.
Energie et longueur de liaison, rayon de covalence, volume occupé par les électrons dans une liaison. Forme des nuages électroniques sigma et pi.
Moments dipolaires
Électronégativité des atomes, échelle de Pauling et Allred-Rochow, évolution dans le tableau périodique. L’hydrogène, le carbone, l’oxygène et l’azote.
Mésomérie et conjugaison, charges formelles
Géométrie des molécules : VSEPR
hypervalence

Chapitre 3 : Interactions intermoléculaires (2h C et 2h TD)
Liaison de Van de Walls, interaction dipôle dipôle, polarisabilité des liaisons.
Liaison hydrogène
Condensation des gaz, miscibilité des liquides

Chapitre 4 : Introduction à la chimie organique et stéréochimie (5h C et 5h de TD)
Nomenclature
Isomères (de squelette, de position et de fonction)
Représentation d’une molécule : (formule brute, formule développé plan, formule topologique, représentation de Cram, projections de Fisher et de Newman)
Chiralité et propriétés optiques d’une molécule (pouvoir rotatoire spécifique)
Conformation (stabilité des conformères), configuration absolue R et S, Règles CIP
Stéréoisomérie (atome stéréogène, éléments de symétrie, isomérie géométrique, énantiomérie et diastéréoisomérie)
Stéréochimie dynamique (réaction stéréospécifique, réaction stéréosélective, racémisation)

Chapitre 5 : Effets électroniques, intermédiaires réactionnels, notion de cinétique (4h C et 6h TD)
Effets électroniques inductifs et mésomères, conjugaison et mésomérie
Intermédiaires réactionnels et leur stabilité relative (carbocation, carbanion et radical)
Notion de cinétique : vitesse d’une réaction chimique, ordre, mécanisme réactionnel Chapitre 6 : Dérivés halogénés : substitutions nucléophiles – éliminations d’ordre 1 ou 2 (4h C et 6h TD)
Structure des dérivés halogénés aliphatiques
Mécanisme SN1/SN2 (interconversion des groupes fonctionnels)
Mécanisme E1/E2
Orientation des réactions (structure du substrat, choix du solvant, basicité ou nucléophilie du réactif, nucléophuge)

30BU05S - UE libre

55BU06OB - OBI transverse : Outils Bureautique et Internet

Responsables pédagogiques : Thierry Stoehr, Claude Bazin

Résumé du programme : Les étudiants de première année de licence (L1) suivent l’UE OBI « Outils pour la Bureautique et Internet » qui est une formation pour l’utilisation de - traitement de texte, - tableur, - espace de stockage - moteur de recherche etc.….

L’enseignement se déroule sur la totalité du semestre avec une alternance : cours en ligne 1 semaine sur deux et TD (2h) en salle. Chaque cours en ligne comporte des documents : vidéo et textes suivis de QCM.
L’enseignement est composé de trois grandes parties : utilisation du traitement de texte, du tableur et présentation d’un travail personnel de recherche sur un thème choisi.

Les modalités de contrôle des connaissances de la première session comportent une note sur les QCM (20%), un examen sur le traitement de texte (20%), une évaluation du travail personnel (30%), un examen de tableur (15%) et un QCM final (15%).

L’UE OBI permet à l’étudiant de valider certaines des compétences du Certificat Informatique et Internet (C2i) niveau 1. Le certificat peut être validé durant les années de licence. Pour plus de précisions, voir les modalités : http://www.script.univ-paris-diderot.fr

Dernière modification, le 2 août 2015.

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30BU01SV - Développement animal et végétal

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L’ADN support de l’information génétique Le polymorphisme de l’ADN : De la mutation au phénotype. Le maintien et le brassage de l’information génétique L’analyse génétique. Transmission des caractères à la méiose Propriétés et synthèse (transcription) de l’ARN chez les procaryotes et chez les eucaryotes, Maturation des ARN eucaryote et importance biologique de l’épissage. Maturation des ARN eucaryote et importance biologique de l’épissage. La traduction procaryote et eucaryote, Les outils du génie génétique, applications en biologie et en santé. 30BU03SV – Outils pour Biologistes 2 Responsables pédagogiques : Laurent Ménard, Mathilde Badoual, Samuel Bottani La quantification occupe aujourd’hui une place croissante en Biologie. Dans ce contexte, l’objectif général du cours est de montrer comment la physique, à travers ses méthodes mais également ses concepts, peut aider à accéder à cette quantification et à mieux appréhender la complexité d’un système biologique. Il s’agit de montrer comment des principes de physique simples peuvent permettre de mieux comprendre le fonctionnement et les limites d’un système biologique. Le cours sera structuré autour d’un thème conducteur riche et accessible, qui ouvre à une grande variété d’exemples : le métabolisme et la transmission d’informations (son, lumière) chez les animaux. Résumé du programme : 1 - Objectifs du cours et introduction à l’interface Maths-Physique-Chimie-Biologie : construire des modèles avec la physique et les mathématiques pour comprendre la biologie ; exemples. 2 et 3 - Les origines du mouvement : notion de force, vitesses, accélération, PFD. Types de forces et d’interactions en Biologie 4 - L’énergie du vivant : différentes formes d’énergie et conservation. Illustration de la conservation de l’énergie à l’échelle cellulaire. 5 - Allométrie et lois d’échelle (métabolisme, effet de la taille) 6 - Cycles et rythmes en biologie : mouvements périodiques, oscillateur harmonique, fréquence de vibration propre, harmoniques, résonance 7 - Introduction aux ondes : ondes mécaniques/EM, propagation, énergie transportée. Ondes et biologie. 8 - Le son : interaction avec la matière (réflexion/réfraction/diffraction), effet Doppler. 9 - Mécanisme de l’audition : formation (membrane oscillante, stridulation, cordes vocales) et détection du son (oreille). Illustration sur les perceptions animales. 10 - La lumière : production (rayonnement thermique, fluorescence, bioluminescence, laser) et interaction avec la matière (ionisation, échauffement) 11 et 12 - Mécanisme de la vision : évolution des yeux. Ouverture à la microscopie. 13 - Les couleurs dans la nature : origine physique, production et perception 30BU04SV - De l’atome à la Chimie organique Responsables pédagogiques : Rémi Losno, Chan Zhi Dong, Thanh Ha Duong Résumé du programme : Chapitre 1 : l’atome (5h C et 5h TD) noyau et électrons : composition du noyau, isotopes et élément, A et Z, forme de l’atome, disposition des électrons en couches et sous-couches, configuration électronique, état fondamental, électrons de coeur et électrons de valence. masse atomique, rayon atomique, composition isotopique naturelle des éléments, masse molaire élémentaire. interaction photon/atome, spectre de l’atome d’hydrogène, niveaux d’énergies, force d’attraction électrique, écrantage des électrons de coeur. forme des nuages électroniques s, p, d Rayon atomique, énergie d’ionisation, affinité électronique, évolution dans le tableau périodique. Chapitre 2 : construire une molécule (6h C et 6h TD) Le modèle de Lewis, règle de l’octet, squelette sigma, liaisons pi et doublets libres. Energie et longueur de liaison, rayon de covalence, volume occupé par les électrons dans une liaison. Forme des nuages électroniques sigma et pi. Moments dipolaires Électronégativité des atomes, échelle de Pauling et Allred-Rochow, évolution dans le tableau périodique. L’hydrogène, le carbone, l’oxygène et l’azote. Mésomérie et conjugaison, charges formelles Géométrie des molécules : VSEPR hypervalence Chapitre 3 : Interactions intermoléculaires (2h C et 2h TD) Liaison de Van de Walls, interaction dipôle dipôle, polarisabilité des liaisons. Liaison hydrogène Condensation des gaz, miscibilité des liquides Chapitre 4 : Introduction à la chimie organique et stéréochimie (5h C et 5h de TD) Nomenclature Isomères (de squelette, de position et de fonction) Représentation d’une molécule : (formule brute, formule développé plan, formule topologique, représentation de Cram, projections de Fisher et de Newman) Chiralité et propriétés optiques d’une molécule (pouvoir rotatoire spécifique) Conformation (stabilité des conformères), configuration absolue R et S, Règles CIP Stéréoisomérie (atome stéréogène, éléments de symétrie, isomérie géométrique, énantiomérie et diastéréoisomérie) Stéréochimie dynamique (réaction stéréospécifique, réaction stéréosélective, racémisation) Chapitre 5 : Effets électroniques, intermédiaires réactionnels, notion de cinétique (4h C et 6h TD) Effets électroniques inductifs et mésomères, conjugaison et mésomérie Intermédiaires réactionnels et leur stabilité relative (carbocation, carbanion et radical) Notion de cinétique : vitesse d’une réaction chimique, ordre, mécanisme réactionnel Chapitre 6 : Dérivés halogénés : substitutions nucléophiles – éliminations d’ordre 1 ou 2 (4h C et 6h TD) Structure des dérivés halogénés aliphatiques Mécanisme SN1/SN2 (interconversion des groupes fonctionnels) Mécanisme E1/E2 Orientation des réactions (structure du substrat, choix du solvant, basicité ou nucléophilie du réactif, nucléophuge) 30BU05S - UE libre 55BU06OB - OBI transverse : Outils Bureautique et Internet Responsables pédagogiques : Thierry Stoehr, Claude Bazin Résumé du programme : Les étudiants de première année de licence (L1) suivent l’UE OBI « Outils pour la Bureautique et Internet » qui est une formation pour l’utilisation de - traitement de texte, - tableur, - espace de stockage - moteur de recherche etc.…. L’enseignement se déroule sur la totalité du semestre avec une alternance : cours en ligne 1 semaine sur deux et TD (2h) en salle. Chaque cours en ligne comporte des documents : vidéo et textes suivis de QCM. L’enseignement est composé de trois grandes parties : utilisation du traitement de texte, du tableur et présentation d’un travail personnel de recherche sur un thème choisi. Les modalités de contrôle des connaissances de la première session comportent une note sur les QCM (20%), un examen sur le traitement de texte (20%), une évaluation du travail personnel (30%), un examen de tableur (15%) et un QCM final (15%). L’UE OBI permet à l’étudiant de valider certaines des compétences du Certificat Informatique et Internet (C2i) niveau 1. Le certificat peut être validé durant les années de licence. Pour plus de précisions, voir les modalités : http://www.script.univ-paris-diderot.fr Dernière modification, le 2 août 2015.


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